CRISPR全稱是Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats(成簇的規(guī)律間隔的短回文重復(fù)序列),而Cas的全稱是CRISPR associated(CRISPR關(guān)聯(lián)),簡稱為CRISPR/Cas系統(tǒng)。CRISPR/Cas這項技術(shù)自從問世以來,已經(jīng)吸引了無數(shù)歡呼和掌聲,在短短兩三年之內(nèi),它已經(jīng)成為了生物科學(xué)領(lǐng)域最炙手可熱的研究工具,但其實CRISPR/Cas系統(tǒng)早就存在自然界中了。CRISPR/Cas系統(tǒng)為細(xì)菌與古細(xì)菌中抵御外源病毒和質(zhì)粒DNA入侵的獲得性免疫機(jī)制系統(tǒng)。作為一種新型的基因組編輯技術(shù),具有設(shè)計簡單、特異性強(qiáng)、效率高等優(yōu)點。在2013年2月15日,張鋒等人將CRISPR/Cas9系統(tǒng)成功應(yīng)用于哺乳動物和人類細(xì)胞的基因編輯,此后迅速成為人類生物學(xué)、農(nóng)業(yè)和微生物學(xué)等領(lǐng)域最流行的基因編輯工具。CRISPR/Cas系統(tǒng)可以分為兩類:第一類系統(tǒng)的核酸酶由多個亞基組成;第二類系統(tǒng)特別受關(guān)注,其核酸酶由單一的蛋白組成,包括基于Cas9、Cas12和Cas13效應(yīng)蛋白的II、V和VI型。
近日,麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué)Broad研究所的Pardis C. Sabeti、張鋒等人在一項新的研究中將一種CRISPR RNA切割酶轉(zhuǎn)變?yōu)橐环N經(jīng)編程后檢測和破壞人細(xì)胞中RNA病毒的抗病毒劑。相關(guān)研究結(jié)果于2019年10月10日在線發(fā)表在Molecular Cell期刊上,文章題目為“Programmable Inhibition and Detection of RNA Viruses Using Cas13”。
研究中通過計算,在數(shù)百種人類可能感染的ssRNA病毒物種中,識別出數(shù)千個潛在的Cas13 crRNA 靶點。
(圖形摘要)
研究人員將Cas13的抗病毒活性與其診斷能力結(jié)合起來,建立了一個強(qiáng)大、快速且可編程的診斷和抗病毒系統(tǒng),命名為CARVER(Cas13輔助的病毒表達(dá)和讀出限制),以檢測和消滅人類細(xì)胞中基于RNA的病毒。研究中分別測試了Cas13對淋巴細(xì)胞性脈絡(luò)叢腦膜炎病毒(LCMV)、甲型流感病毒(IAV)和水泡性口炎病毒(VSV)三種不同RNA病毒的人類細(xì)胞中的活性。研究人員將Cas13基因片段和一種工程化的引導(dǎo)RNA導(dǎo)入細(xì)胞,24小時后,將細(xì)胞暴露在病毒中。再過24小時后,Cas13酶使細(xì)胞培養(yǎng)中的病毒RNA水平降低了多達(dá)40倍。
(cas13有效降低哺乳動物細(xì)胞中病毒RNA的水平)
研究小組進(jìn)一步研究了Cas13對病毒感染性的影響。數(shù)據(jù)表明,在病毒暴露8小時后,Cas13將流感病毒的傳染性降低了300多倍。
為了增加診斷需求,研究人員還采用了基于Cas13的核酸檢測技術(shù)SHERLOCK。這個三合一的CARVER系統(tǒng)可以快速測量樣品中病毒RNA的剩余水平。
此次研究能夠迅速開發(fā)針對各種已知和新發(fā)現(xiàn)的人類病原體的抗病毒藥物,對傳染病的診斷和治療具有重大意義。
參考文獻(xiàn):Programmable Inhibition and Detection of RNA Viruses Using Cas13